A principal diferença entre GFP e EGFP é que o GFP é uma proteína de tipo selvagem incorporada na clonagem molecular de células de não mamíferos, enquanto o EGFP é um tipo melhorado ou modificado de GFP que pode ser usado em células de mamíferos.
A clonagem molecular é uma técnica avançada que os cientistas usam imensamente para expressar proteínas por meio de tecnologia recombinante. Na tecnologia do DNA recombinante, é necessário transformar o vetor recombinante com sucesso no organismo hospedeiro. Assim, durante o processo de transformação, deve-se identificar e confirmar se o gene de interesse foi transformado ou não para o hospedeiro. Para avaliar isso, os biólogos moleculares adotam várias técnicas. Dessas técnicas, uma é o gene repórter. Esses genes repórter atuam como marcadores selecionáveis para selecionar os transformantes corretos. Assim, a Proteína Fluorescente Verde (GFP) e a Proteína Fluorescente Verde Melhorada (EGFP) são duas proteínas repórter usadas na clonagem molecular.
