A principal diferença entre o fragmento Klenow e a DNA polimerase 1 é que o fragmento Klenow é uma grande porção da DNA polimerase 1 que carece de 5 ′ a 3 ′ atividade de exonuclease, enquanto a DNA polimerase é uma enzima de E. coli que tem todos os três domínios, incluindo 5 ′ a 3 ′ atividade de exonuclease.
A DNA polimerase é uma das principais enzimas envolvidas na replicação do DNA em organismos vivos. Existem diferentes formas da enzima DNA polimerase encontradas em eucariotos e procariontes com base no tamanho e na forma. A DNA polimerase 1, 2 e 3 são encontradas apenas em organismos procarióticos e desempenham papéis diferentes na replicação do DNA. A DNA polimerase 1 tem três domínios com 5 ′ a 3 ′ polimerase, 3 ′ a 5 ′ atividade de exonuclease e 5 ′ a 3 ′ atividade de exonuclease. O fragmento de Klenow é um produto proteolítico da DNA polimerase 1. Possui 5 a 3 ′ polimerase e 3 ′ a 5 ′ atividades de exonuclease da DNA polimerase 1 intacta, mas não possui a atividade de 5 ′ a 3 ′ exonuclease.