A principal diferença entre epistasia e pleiotropia é que epistasia é o fenômeno no qual um gene em um locus altera a expressão fenotípica de um gene em outro locus enquanto a pleiotropia explica o fenômeno no qual um único gene afeta múltiplas características fenotípicas.
Epistasia e pleiotropia são dois fenômenos da genética. A epistasia ocorre quando mais de um gene determina um único fenótipo. Portanto, na epistasia, um gene influencia a expressão de outro gene localizado em um locus diferente. Em contraste, a pleiotropia ocorre quando um gene determina vários fenótipos. Portanto, um gene contribui para várias características. Tanto a epistasia quanto a pleiotropia são variações da herança mendeliana.
