A principal diferença entre a hematoxilina de Harris e Mayer é que a hematoxilina de Harris é usada na coloração regressiva enquanto a hematoxilina de Mayer é usada na coloração progressiva.
A hematoxilina é um corante básico comumente usado em histopatologia. É um corante natural extraído da árvore Haematoxylon campechianum. É um corante de cor azul escuro ou roxo. A hematoxilina permite a demonstração de detalhes nucleares microscópicos de componentes celulares e teciduais. Este corante tem carga positiva, portanto, liga-se a substâncias com carga negativa, como DNA e RNA, e os tinge de cor violeta. A hematoxilina requer um mordente para ajudar na ligação com os componentes do tecido. Um mordente é um produto químico, especialmente um sal de alumínio, ferro, tungstênio, que facilita a ligação de um corante ao componente do tecido.
Com base nos mordentes que contêm, existem vários tipos de hematoxilinas disponíveis. Algumas delas são as hematoxilinas de Ehrlich, Mayer, Harris, Gill, Delafield, Cole e Carazzi. As formulações de hemoxilina de Harris e Mayer são hematoxilinas mordentes à base de alumínio.