A principal diferença entre a fusão nuclear e a fissão é que a fusão nuclear é a combinação de dois ou mais átomos para criar um grande átomo, enquanto a fissão nuclear é a divisão de um átomo maior em duas ou partículas atômicas menores.
Na física, uma ação sempre tem uma reação igual, mas oposta. Esta é a filosofia definitiva da física; assim, todos os eventos e ações sempre têm uma reação oposta correspondente. Além disso, este é o núcleo principal da fusão nuclear e da reação de fissão nuclear também. Esses são dois tipos diferentes de reações que liberam certas quantidades de energia. Na química simples, um cria átomos menores enquanto o outro combina átomos para formar um átomo maior.