A principal diferença entre os compostos Endo e Exo Diels Alder é que o produto Endo Diels Alder tem seus substituintes na mesma face do sistema de anéis em ponte, enquanto o produto Exo Diels Alder tem seus substituintes nas faces opostas do sistema de anéis em ponte.
Isomeria Endo-Exo é um tipo especial de isomeria que se enquadra na categoria de estereoisômeros. Podemos encontrar este isomerismo em compostos orgânicos tendo um substituinte em seu sistema de anéis em ponte. Endo e Exo são prefixos que usamos para nomear um composto orgânico de acordo com a localização desse substituinte. Principalmente, usamos esses prefixos com os produtos da reação de Diels Alder. O produto deste tipo de reação é geralmente um derivado de ciclohexeno substituído.