A principal diferença entre células-tronco pluripotentes e pluripotentes induzidas é que as células pluripotentes são células-mãe indiferenciadas (de embriões, etc.), que têm a capacidade natural de se diferenciar em diferentes tipos de células, enquanto as células-tronco pluripotentes induzidas são células adultas somáticas que têm foram geneticamente reprogramadas para mostrar características semelhantes às células-tronco pluripotentes naturais.
Uma célula-tronco é uma célula indiferenciada que tem a capacidade única de se desenvolver em células diferentes ou especializadas. Além disso, as células-tronco são de três tipos: unipotentes, pluripotentes e multipotentes. Se uma célula-tronco pode se diferenciar em um, vários e em todos os tipos de células, ela é conhecida como célula-tronco unipotente, multipotente ou pluripotente, respectivamente. Entre os três tipos acima, as células-tronco pluripotentes são importantes, pois podem se diferenciar em todos os tipos de células. Uma célula-tronco embrionária pluripotente pode se desenvolver em um ser humano completo.
