A principal diferença entre Ubiquinonas e Citocromos é que as Ubiquinonas (CoQ) não são proteínas, enquanto os Citocromos são proteínas.
A cadeia de transporte de elétrons é o estágio final da respiração aeróbica. Portanto, ocorre na membrana interna da mitocôndria. Além disso, consiste em portadores de elétrons que facilitam a produção de um gradiente de prótons através da membrana. Além de NAD e flavoproteínas, Ubiquinonas e Citocromos são dois tipos de transportadores de elétrons envolvidos na cadeia de transporte de elétrons. Ubiquinonas são moléculas orgânicas hidrofóbicas e lipossolúveis não proteicas, enquanto os citocromos são proteínas que contêm ferro.
