A principal diferença entre o ácido conjugado e a base conjugada é que os ácidos conjugados doam prótons, enquanto as bases conjugadas aceitam prótons.
Em 1923, dois cientistas, Bronsted e Lowry, apresentaram uma teoria sobre o comportamento ácido-base. De acordo com a teoria de Bronsted-Lowry, um ácido é um doador de prótons e uma base é um aceitador de prótons. Portanto, uma molécula para se comportar como um ácido deve encontrar um aceitador de prótons. Por outro lado, uma molécula para se comportar como base deve encontrar um doador de prótons. Portanto, para uma reação ácido-base, os doadores e aceitadores de prótons devem estar presentes. No entanto, a água pode atuar tanto como ácido quanto como base. Quando a água aceita um próton, ela forma um íon hidrônio e, quando doa um próton, produz um íon hidróxido.