A principal diferença entre a proteína simples e a proteína conjugada é que as proteínas simples são feitas de aminoácidos unidos para formar uma molécula grande, enquanto as proteínas conjugadas são moléculas complexas contendo proteínas simples e componentes não proteicos.
Uma proteína é uma molécula de biopolímero. Que significa; uma molécula de proteína contém várias unidades repetidas ligadas a ligações covalentes. Essas unidades repetidas representam os aminoácidos que foram usados na formação da proteína. De acordo com a composição química das proteínas, existem dois tipos de proteínas, como proteínas simples e proteínas conjugadas.