A principal diferença entre o oligopeptídeo e o polipeptídeo é que os oligopeptídeos contêm poucos resíduos de aminoácidos, enquanto os polipeptídeos contêm um grande número de resíduos de aminoácidos.
Os termos oligopeptídeos e polipeptídeos vêm na categoria de proteínas. Os peptídeos são cadeias curtas de aminoácidos. Os aminoácidos ligam-se uns aos outros através de ligações peptídicas. Portanto, podemos categorizar esses peptídeos de acordo com o número de aminoácidos presentes nesses peptídeos. Por exemplo, dipeptídeos, tripeptídeos, tetrapeptídeos, oligopeptídeos e polipeptídeos.