A principal diferença entre plasmídeo e cromossomo é que o plasmídeo é uma estrutura de DNA extra-cromossômico de fita dupla circular de bactérias, enquanto o cromossomo é uma estrutura semelhante a um fio bem organizado que contém DNA genômico firmemente enrolado com proteínas.
A célula bacteriana contém um cromossomo e vários círculos de DNA extra-cromossômicos chamados plasmídeos. O cromossomo bacteriano contém o DNA genômico das bactérias. Além disso, o DNA genômico eucariótico também existe como cromossomos. O genoma humano possui 46 cromossomos. Geralmente, os plasmídeos estão presentes em bactérias e arqueas. Embora as bactérias tenham plasmídeos, eles não contêm os genes essenciais para a sobrevivência das bactérias e suas funções principais. No entanto, os plasmídeos contêm vários genes que fornecem vantagens adicionais às bactérias, como resistência a antibióticos, tolerância à seca, resistência a herbicidas, etc. O objetivo deste artigo é discutir a diferença entre plasmídeo e cromossomo em detalhes.