A principal diferença entre mesênquima e ectomesênquima depende do tipo de células que eles contêm. O mesênquima contém células soltas que migram facilmente para formar o tecido básico de colágeno e tecido ósseo e cartilaginoso, enquanto o ectomesênquima contém células da crista neural e forma os tecidos do pescoço e do crânio.
Tanto o mesênquima quanto o ectomesênquima estão presentes no estágio embrionário. O desenvolvimento do mesênquima e do ectomesênquima é importante para estudar o desenvolvimento dos vários tecidos que surgem dessas células.
