A principal diferença entre FISH e CGH é que FISH é uma técnica molecular que detecta uma sequência específica de DNA em um cromossomo usando sondas marcadas com fluorescência, enquanto CGH é outra técnica citogenética molecular que detecta alterações no DNA genômico.
A análise citogenética desempenha um papel importante na medicina ao detectar anormalidades cromossômicas, como aneuploidias, deleções, duplicações e rearranjos, etc. Anormalidades cromossômicas eventualmente levam a doenças genéticas, como câncer, infertilidade, síndrome de Down, síndrome de Klinefelter, síndrome de Turner, leucemia, etc. Existem vários métodos citogenéticos moleculares para detectar os defeitos e doenças mencionados acima. Entre eles, FISH (hibridização fluorescente in situ) e CGH (hibridização genômica comparativa) são duas técnicas poderosas de hibridização. No entanto, ambos os métodos têm prós e contras.
