A principal diferença entre aquênio e cipsela é que o aquênio é um fruto simples e indeiscente seco que se origina de um ovário superior. Já a cipsela é um fruto simples e indeiscente, seco, que se origina de um ovário inferior.
Os frutos são uma estrutura única de angiospermas. É o ovário amadurecido ou ovário maduro após a fertilização. Além disso, existem três tipos de frutas como frutas simples, frutas agregadas e frutas múltiplas. Aqui, frutas simples podem ser novamente divididas em frutas secas e frutas carnudas. Frutos secos simples têm pericarpo seco. Além disso, os frutos secos se dividem em três tipos; deiscente, indeiscente e esquizocárpico. Aquene e cipsela são dois tipos de frutos simples indeiscentes secos. Aquene não tem um papelo (um cálice modificado) anexado, enquanto a cipsela tem um pappo anexado.