A principal diferença entre ligação genética e desequilíbrio de ligação é que ligação genética é a tendência de dois ou mais genes do mesmo cromossomo permanecerem juntos no processo de herança, enquanto o desequilíbrio de ligação é a associação não aleatória de alelos em diferentes loci em uma população.
A ligação genética e o desequilíbrio de ligação são dois conceitos em genética que seguem a herança não-Mendeliana. A ligação genética se refere ao estado físico de estar ligado a um cromossomo. Em palavras simples, é o processo pelo qual os genes estão localizados intimamente em um cromossomo, de modo que são sempre herdados juntos em gametas. Por outro lado, na genética de populações, o desequilíbrio de ligação se refere à associação não aleatória de alelos em diferentes loci em uma população. É a medida da diferença entre a frequência observada de uma combinação particular de alelos em dois loci e a frequência esperada para a associação aleatória.
