A principal diferença entre os aminoácidos glicogênicos e cetogênicos é que os aminoácidos glicogênicos produzem piruvato ou qualquer outro precursor da glicose durante seu catabolismo, enquanto os aminoácidos cetogênicos produzem acetil CoA e acetoacetil CoA durante seu catabolismo.
Os aminoácidos são as moléculas fundamentais que compõem a estrutura química das proteínas e polipeptídeos. Embora existam diferentes classificações para os aminoácidos, podemos classificá-los como aminoácidos glicogênicos e cetogênicos, dependendo dos intermediários que formam durante o catabolismo. Como mencionado acima, o produto final do catabolismo de aminoácidos dá dois tipos de produtos intermediários; quer piruvato (ou a outros precursores de glicose) ou acetil CoA e acetoacetil CoA.