Diferença chave - exome vs transcriptoma
Um gene contém regiões codificantes e não codificantes dentro dele. As sequências codificantes são conhecidas como exões e as sequências não codificantes são conhecidas como intrões. A sequência de nucleotídeos dos exons de um gene representa o código genético do gene para sintetizar a proteína específica. Portanto, os exons permanecem na molécula de mRNA. A região total do exon do genoma é conhecida como exoma e é uma parte importante do genoma. O código genético dos genes é convertido no código genético da molécula de mRNA, necessária para a produção da proteína. Todas as moléculas de mRNA transcritas em uma célula ou população de células de cada vez são conhecidas como transcriptoma. A principal diferença entre o exoma e o transcriptoma é que o exoma representa as sequências das regiões do exon do genoma, enquanto o transcriptoma representa o mRNA total de uma célula ou tecido em um determinado momento.
CONTEÚDO
1. Visão geral e diferença fundamental
2. O que é Exome
3. O que é transcriptoma
4. Comparação lado a lado - Exome vs Transcriptoma
5. Resumo
O que é Exome?
Os genes são compostos de exons, íntrons e sequências regulatórias. Os exons são as regiões do gene que são transcritas na sequência de mRNA durante a transcrição. Os íntrons e outras regiões não codificantes são removidos durante a transcrição. A sequência de nucleotídeos dos exons determina o código genético do gene que sintetiza a proteína específica que codifica. Apenas os exons permanecem dentro do mRNA de uma proteína. A coleção de exons no genoma é conhecida como exoma de um organismo. Ele representa uma parte do genoma que é expressa em genes. Em humanos, o exoma representa 1% do genoma. É a porção codificadora de proteínas do genoma humano.
Figura 01: Exome
O que é transcriptoma?
O transcriptoma é a coleção de todas as transcrições codificantes e não codificantes de proteínas (RNAs) em um determinado tecido. O transcriptoma representa a coleção de moléculas de mRNA totais expressas pelos genes em uma célula ou tecido. O transcriptoma de uma célula pode ser variado com o transcriptoma de outro tipo de célula. O transcriptoma também é dinâmico - ele muda com o tempo em resposta a estímulos internos e externos. Mesmo dentro do mesmo tecido ou dentro do mesmo tipo de célula, o transcriptoma pode mudar após alguns minutos.
O transcriptoma difere do exoma de um organismo. O transcriptoma inclui apenas as sequências de exoma expressas. Embora o exoma de uma célula permaneça o mesmo, o transcriptoma difere entre as células, uma vez que a expressão do gene não é a mesma para todas as células ou tecidos. Apenas genes essenciais são expressos em diferentes células e tecidos. A expressão gênica é um processo específico de tecido ou tipo de célula. É regulado por vários fatores, incluindo fatores ambientais. Portanto, o transcriptoma pode variar com as condições ambientais externas.
O transcriptoma é usado como um precursor para estudos de proteômica. Todas as proteínas são derivadas de sequências de mRNA. Modificações translacionais podem resultar em mudanças nas proteínas. No entanto, o transcriptoma fornece informações básicas importantes para os estudos proteômicos.
Figura 02: Transcriptoma de células-tronco embrionárias
Qual é a diferença entre Exome e Transcriptome?
Artigo Diff meio antes da tabela
Exome vs transcriptoma |
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| Exome é a coleção da região codificadora de proteínas dos genes. | O transcriptoma é a coleção de todo o RNA transcrito, incluindo o mRNA. |
| Amostra | |
| Exome é estudado usando amostra de DNA. | O transcriptoma é estudado usando uma amostra de RNA. |
| Método de Estudo | |
| O sequenciamento completo do exoma é o método de estudar o exoma. | O sequenciamento de RNA é o método de estudar o transcriptoma. |
Resumo - Exome vs Transcriptoma
Os exons são as sequências de codificação dos genes e determinam as sequências de mRNA das proteínas. A coleção dessas sequências codificantes (exons) é conhecida como exoma de um organismo. Os genes são transcritos em moléculas de mRNA antes de fazer as proteínas. As moléculas de mRNA totais de uma célula ou tecido em um determinado momento são conhecidas como transcriptoma. O transcriptoma representa os genes que estão sendo expressos ativamente em mRNA a qualquer momento. O transcriptoma é específico da célula e do tecido e afeta as condições ambientais. Esta é a diferença entre exoma e transcriptoma.
