A principal diferença entre a terapia gênica somática e a linha germinativa depende do tipo de células usadas para fazer a terapia gênica. Terapia gênica somática refere-se à introdução ou alteração de genes em células somáticas. Terapia genética da linha germinativa refere-se à introdução ou alteração de genes nas células germinativas.
A terapia gênica é atualmente um novo campo de tratamento, pois visa a causa da doença. Ao alterar os genes responsáveis por uma determinada condição de doença, é possível eliminar a doença em um estágio inicial. Portanto, a terapia gênica tem mostrado novos métodos na cura e eliminação de doenças.