A principal diferença entre o sistema de arquivos e o banco de dados é que o sistema de arquivos gerencia apenas o acesso físico, enquanto o banco de dados gerencia o acesso físico e lógico aos dados.
Banco de dados e sistema de arquivos são dois métodos que ajudam a armazenar, recuperar, gerenciar e manipular dados. Ambos os sistemas permitem que o usuário trabalhe com dados de forma semelhante. Um sistema de arquivos é uma coleção de arquivos de dados brutos armazenados no disco rígido, enquanto um banco de dados se destina a organizar, armazenar e recuperar facilmente grandes quantidades de dados. Em outras palavras, um banco de dados contém um pacote de dados organizados, normalmente em formato digital para um ou mais usuários. A abreviatura do banco de dados é DB. É possível classificar o BD de acordo com seu conteúdo, como documento-texto, bibliográfico e estatístico. É importante observar que, mesmo em um banco de dados, os dados são eventualmente ou fisicamente armazenados em alguns arquivos.