A principal diferença entre Coliformes e Enterobacteriaceae é que os Coliformes são um grupo de bactérias Gram negativas, em forma de bastonete e fermentadoras de lactose, enquanto Enterobacteriaceae é uma grande família de bactérias Gram negativas.
Organismos indicadores são os organismos que têm o uso como signos para indicar uma situação particular. Eles indicam a presença de algo que não é normal. Coliformes e Enterobacteriaceae são bactérias indicadoras que indicam sinais da qualidade sanitária dos alimentos e da água e também indicam as condições do meio ambiente. Além disso, todos os coliformes pertencem a Enterobacteriaceae, mas todos os membros de Enterobacteriaceae não são coliformes.