A principal diferença entre a desaminação oxidativa e não oxidativa é que a desaminação oxidativa ocorre por meio da oxidação dos aminoácidos do grupo amino, enquanto a desaminação não oxidativa ocorre por meio de outras reações que não a oxidação.
A desaminação é, como seu nome descreve, a remoção de um grupo amina de qualquer molécula. Estas são reações químicas catalisadas por enzimas desaminase. Em nosso corpo, esse tipo de reação ocorre no fígado e às vezes também nos rins (ex: desaminação do glutamato nos rins). Lá, o grupo amina removido se converte em amônia e é excretado de nosso corpo. Além disso, existem quatro reações principais que ocorrem como reações de desaminação; eles são oxidação, redução, hidrólise e reações intramoleculares. Destas, exceto para a oxidação, outras reações são reações não oxidativas.