A principal diferença entre os inibidores da transcriptase reversa de nucleosídeo e nucleotídeo é que os inibidores da transcriptase reversa de nucleosídeo devem ser fosforilados pelas quinases celulares do hospedeiro, enquanto os inibidores da transcriptase reversa de nucleotídeo não precisam sofrer fosforilação inicial.
A transcriptase reversa é uma enzima que converte a molécula de RNA em ssDNA. HIV e retrovírus possuem esta enzima para sintetizar ssDNA a partir de seu genoma de RNA dentro da célula hospedeira. Assim, é possível prevenir as infecções por HIV e outros retrovírus, inibindo a atividade da enzima transcriptase reversa, evitando assim a síntese de genomas virais e a multiplicação viral. Os inibidores da transcriptase reversa são uma classe de medicamentos anti-retrovirais usados para tratar esse tipo de infecções virais. Esses medicamentos têm como alvo a enzima transcriptase reversa e previnem sua ação catalítica, bloqueando a síntese de DNA a partir de RNA viral. Os inibidores da transcriptase reversa de nucleosídeos e nucleotídeos são dois tipos de drogas. Esses inibidores são muito importantes, especialmente no tratamento da AIDS.