A principal diferença entre epiblasto e hipoblasto é que o epiblasto é uma das duas camadas do disco embrionário que forma três camadas germinativas primárias (ectoderme, endoderme definitivo e mesoderma), ectoderme amniótico e mesoderme extraembrionário, enquanto o hipoblasto é a segunda camada de o disco embrionário que forma o saco vitelino.
A fecundação é o processo de unir uma célula-ovo com um espermatozóide, formando um zigoto diplóide. O zigoto, então, eventualmente se desenvolve em um embrião por meio de divisões celulares e diferenciação celular. Após alguns dias de fertilização, o zigoto sofre várias clivagens celulares e forma o estágio de mórula, que é o estágio de 16 células. Possui duas massas celulares denominadas massa celular interna (embrioblasto) e massa celular externa (trofoblasto). Além disso, a massa celular interna forma as duas camadas celulares - epiblasto e hipoblasto - que formarão o embrião e o saco vitelino, respectivamente. A massa celular externa fará parte da placenta.