A principal diferença entre a Face Cis e Trans do Aparelho de Golgi é que a face Cis do Aparelho de Golgi é o lado receptor das vesículas do ER áspero para o Aparelho de Golgi, enquanto a Face Trans do Aparelho de Golgi é o lado de envio das vesículas preenchidas com proteínas do aparelho de Golgi para outros lugares.
O aparelho de Golgi é uma das organelas celulares. Portanto, consiste em vesículas e cisternas. É a organela celular que envolve a classificação e o empacotamento de proteínas intracelularmente antes do transporte para algum outro lugar. O retículo endoplasmático forma vesículas e passa para o aparelho de Golgi. A face cis do aparelho de Golgi recebe vesículas, que se aglutinam para formar cisternas. As cisternas amadurecem e se movem na direção da face cis para trans. Da face transversal do aparelho de Golgi, vesículas partem do aparelho de Golgi carregando proteínas específicas para outros lugares.