A principal diferença entre a auxina e a citocinina é que a auxina estimula a ramificação da raiz, enquanto a citocinina inibe a ramificação e a formação lateral da raiz. Para adicionar mais a isso, auxina é principalmente responsável pelo alongamento das células nas pontas do caule e da raiz, enquanto as citocininas são principalmente responsáveis pela divisão celular e, portanto, são encontradas em áreas de crescimento.
Os fitohormônios, também conhecidos como hormônios vegetais, são substâncias químicas importantes para o crescimento e desenvolvimento das plantas. São moléculas orgânicas e funcionam como moléculas sinalizadoras que regulam o desenvolvimento das plantas. Existem cinco tipos principais de hormônios vegetais: auxina, giberelina, citocinina, etileno e ácido abscísico. Assim, eles desempenham diferentes funções sozinhos e juntos para influenciar o crescimento das plantas.