A principal diferença entre a imunofluorescência direta e indireta é que a imunofluorescência direta usa um único anticorpo que funciona contra o alvo de interesse, enquanto a imunofluorescência indireta usa dois anticorpos para marcar o alvo de interesse.
A imunofluorescência ou imagem celular é uma técnica usada para marcar um antígeno alvo específico com um fluoróforo. Aqui, o fluoróforo é um composto químico fluorescente que pode reemitir luz mediante excitação de luz. Quando um fluoróforo se liga ao antígeno alvo, ele permite a detecção da molécula alvo na amostra. Para descrevê-lo melhor, quando um antígeno se liga a um anticorpo específico, ele pode ser conjugado com fluoróforos. Portanto, é fácil detectar a presença do antígeno alvo na amostra ao observá-lo ao microscópio de fluorescência.
Além disso, existem dois tipos de imunofluorescência; imunofluorescência direta e indireta. A diferença entre imunofluorescência direta e indireta reside principalmente no número de anticorpos usados e na conjugação do fluoróforo. Ou seja, na imunofluorescência direta, o fluoróforo se conjuga diretamente com o anticorpo primário, enquanto na imunofluorescência indireta, o fluoróforo se conjuga com o anticorpo secundário.