A principal diferença entre a redução assimilatória e dissimilatória do sulfato é que a redução assimilatória do sulfato produz cisteína como produto final, enquanto a redução dissimilatória do sulfato produz sulfeto como produto final.
A redução do sulfato é uma das principais vias respiratórias anaeróbias. Além disso, alguns micróbios que dependem de condições anaeróbias são capazes de reduzir os sulfatos para obter energia. Além disso, existem duas vias principais nas quais os sulfatos reduzem; eles são a via assimilatória e a via dissimilatória. Em que, na via assimilatória, a redução do sulfato produz Cisteína como seu produto final, que pode ser assimilado em organismos vivos, como plantas e eucariotos superiores. Pelo contrário, a via dissimilatória da redução do sulfato produz sulfeto como produto final. Portanto, a diferença mais significativa e distinguível entre a redução de sulfato assimilatória e dissimilatória é o tipo de produto final que cada produto produz.