A principal diferença entre as hélices alfa e beta depende do tipo de ligação de hidrogênio que elas formam no desenvolvimento dessas estruturas. As hélices alfa formam ligações de hidrogênio intramoleculares, enquanto as hélices beta formam ligações de hidrogênio intermoleculares.
As proteínas complexas têm quatro níveis organizacionais estruturais - primário, secundário, terciário e quaternário. As estruturas secundárias das proteínas formam as cadeias peptídicas em diferentes orientações. As cadeias peptídicas consistem em sequências de aminoácidos ligadas por ligações peptídicas. Portanto, existem duas estruturas secundárias principais nas proteínas como a hélice alfa e a hélice beta. Além disso, existem outras estruturas secundárias chamadas de volta beta e estruturas em gancho. Principalmente, este artigo enfoca a diferença entre a hélice alfa e beta.