A principal diferença entre a glutamina e a L-glutamina é que a glutamina é um aminoácido, enquanto a L-glutamina é um isômero da glutamina.
Um aminoácido é uma molécula simples formada com C, H, O, N e talvez S. Todos os aminoácidos têm grupos –COOH, -NH2 e –H ligados a um carbono. No entanto, o grupo R difere de aminoácido para aminoácido. No aminoácido mais simples, o grupo R é um átomo de hidrogênio; nós o chamamos de glicina. Existem cerca de 20 aminoácidos comuns. Alguns deles são essenciais para nós, enquanto outros não são essenciais. A glutamina é um dos principais aminoácidos não essenciais.