A principal diferença entre linhagem e cariótipo é que linhagem é a representação do padrão de herança de um traço particular entre os membros da mesma família, enquanto o cariótipo é um diagrama que mostra o número cromossômico e a constituição no núcleo celular de um indivíduo.
A linhagem representa a história familiar de uma característica particular, especialmente a herança de um gene. Um cariótipo é um diagrama que mostra o número cromossômico e a constituição no núcleo da célula de um indivíduo. Ele revela informações sobre o número, tamanho, forma, posição do centrômero dos cromossomos, etc. em um microscópio de luz. Tanto a linhagem quanto o cariótipo fornecem informações importantes sobre doenças genéticas.
