A principal diferença entre a fissão binária e o brotamento é que a fissão binária envolve a divisão da célula-mãe em duas partes por divisão celular mitótica seguida por citocinese, sem a formação de um desabrochar ou de um botão, enquanto que o brotamento envolve a formação de um botão ou de a célula-mãe.
A reprodução assexuada é um dos dois tipos de reprodução em que a prole provém de um único progenitor. Não envolve dois pais ou fusão de dois tipos de gametas ou meiose. Conseqüentemente, os descendentes são geneticamente idênticos ao pai e são clones. A reprodução assexuada é comum entre os procariontes e em alguns eucariotos unicelulares e multicelulares. Existem diferentes métodos assexuados, como fissão binária, brotamento, regeneração, partenogênese, etc.