A principal diferença entre o brotamento exógeno e endógeno é que no brotamento exógeno, o novo organismo ou botão se desenvolve na superfície da mãe-progenitora e então amadurece e se desprende dele, enquanto no brotamento endógeno, o novo organismo ou botão se desenvolve dentro da mãe célula.
Brotamento é um tipo de reprodução assexuada a partir da qual um novo filho se desenvolve ligado ao pai ou mãe. Ela ocorre a partir de uma conseqüência ou botão. Geralmente, um botão se desenvolve na célula-mãe e se estende para o exterior. Então, ele amadurece e se separa da mãe-mãe, tornando-se um organismo independente. Assim, esse tipo de brotamento é denominado brotamento exógeno. Mas, em alguns organismos, brotamento interno também é visto. Aqui, um botão ou uma célula filha é produzida dentro da célula-mãe. Portanto, isso é chamado de brotamento endógeno.