A principal diferença entre o efeito fundador e a deriva genética é que um efeito fundador é um evento de deriva genética em que um pequeno grupo se separa da população principal para estabelecer uma colônia, enquanto a deriva genética se refere às mudanças aleatórias de frequências de alelos em pequenas populações que causam o desaparecimento de genes específicos com o tempo.
Evolução é o processo que explica a mudança de características nos organismos ao longo de gerações sucessivas. A evolução depende da seleção natural e da deriva genética. Devido à seleção natural, as características favoráveis permanecem nas populações enquanto as características desfavoráveis diminuem das populações ao longo do tempo. Da mesma forma, a deriva genética causa mudanças aleatórias nas frequências dos alelos em pequenas populações, devido ao eventual desaparecimento de genes específicos devido à morte ou ao evitar a reprodução. O efeito fundador e o efeito gargalo são dois eventos de deriva genética.
