A principal diferença entre a teoria orbital molecular e a teoria da hibridização é que a teoria orbital molecular descreve a formação de orbitais de ligação e anti-ligação, enquanto a teoria de hibridização descreve a formação de orbitais híbridos.
Existem diferentes teorias desenvolvidas para determinar as estruturas eletrônicas e orbitais das moléculas. A teoria VSEPR, a teoria de Lewis, a teoria das ligações de valência, a teoria da hibridização e a teoria orbital molecular são teorias importantes. A teoria mais aceitável entre eles é a teoria orbital molecular.