A principal diferença entre a ionização positiva e negativa na espectrometria de massa é que a ionização positiva forma íons carregados positivamente, enquanto a ionização negativa forma íons carregados negativamente.
A espectrometria de massa ou MS é uma técnica em química analítica que mede a razão massa-carga dos íons. O resultado final desta técnica vem como um espectro de massa que aparece como um gráfico de intensidade. Além disso, este gráfico é desenhado como uma função da razão massa-carga. Para espectrometria de massa, o instrumento que usamos é um espectrômetro de massa. Quando introduzimos nossa amostra neste instrumento, as moléculas da amostra sofrem ionização. Aqui, escolher a técnica de ionização adequada é muito importante porque tem um grande impacto no resultado final. Se usarmos um gás reagente, por exemplo, amônia, ele fará com que a ionização das moléculas da amostra forme apenas íons positivos ou apenas íons negativos, dependendo da configuração do instrumento.
