A principal diferença entre similaridade e identidade no alinhamento de sequências é que similaridade é a semelhança (semelhança) entre duas sequências em comparação, enquanto identidade é o número de caracteres que correspondem exatamente entre duas sequências diferentes.
Bioinformática é um campo interdisciplinar da ciência que envolve principalmente biologia molecular e genética, ciência da computação, matemática e estatística. O alinhamento de sequência é um termo importante em bioinformática. É o procedimento no qual as sequências de DNA, RNA ou proteína são organizadas para identificar regiões de semelhança que são uma consequência da relação funcional, estrutural ou evolutiva entre as sequências. No final do alinhamento, eles serão apresentados como linhas dentro de uma matriz. Para alinhar os caracteres idênticos em colunas sucessivas, lacunas inseridas estão presentes entre os resíduos.
