A principal diferença entre homologia e similaridade em bioinformática é que homologia se refere a uma declaração sobre ancestralidade evolutiva comum de duas sequências, enquanto similaridade se refere ao grau de semelhança entre duas sequências.
Bioinformática é um campo da ciência que combina biologia, engenharia da informação, ciência da computação, matemática e estatística para analisar e interpretar dados biológicos. Homologia e similaridade são dois termos que usamos no campo da bioinformática. Podemos calcular facilmente a similaridade como uma porcentagem de resíduos semelhantes em um determinado comprimento do alinhamento. No entanto, não podemos calcular a homologia, uma vez que pode ser verdadeira ou falsa e geralmente depende da hipótese usada.
