A principal diferença entre o citocromo e o fitocromo é que o citocromo é uma proteína heme de transferência de elétrons envolvida na respiração aeróbica. Enquanto isso, o fitocromo é uma proteína fotorreceptora que é sensível à luz vermelha e vermelha distante do espectro visível.
Os organismos vivos têm diferentes tipos de pigmentos. Alguns são pigmentos que absorvem a luz, enquanto outros são pigmentos respiratórios. O citocromo é uma metaloproteína que atua como um transportador de elétrons na respiração aeróbia. Enquanto isso, o fitocromo é um fotorreceptor que absorve a luz vermelha e vermelha distante do espectro visível. Em comparação com o citocromo, os fitocromos são importantes em muitos aspectos do desenvolvimento das plantas.