A principal diferença entre hnRNA e mRNA é que hnRNA é o transcrito de mRNA prematuro não processado que contém íntrons, enquanto o mRNA é o RNA processado que não contém íntrons.
Existem diferentes tipos de RNA, e hnRNA e mRNA são dois tipos deles. O RNA nuclear heterogêneo, também conhecido como pré-mRNA, é um tipo de transcrição primária produzida dentro do núcleo. Uma vez que o pré-mRNA é feito, ele é pós-transcricionalmente processado em mRNA funcional, que pode ser traduzido em uma proteína no citoplasma. Portanto, o hnRNA é sintetizado a partir de um molde de DNA, e é um RNA recém-formado antes do processamento. mRNA é a sequência de RNA que carrega a informação genética para produzir uma proteína. É uma forma de RNA após o processamento. Além disso, o mRNA carrega códons genéticos do DNA no núcleo para os ribossomos para a síntese de proteínas.
