A principal diferença entre acidofílicos e basofílicos é que os componentes acidofílicos de uma célula são amantes do ácido e os corantes ácidos são usados para corá-los, enquanto os componentes basofílicos de uma célula amam a base e os corantes básicos são usados para corá-los.
A coloração é uma técnica usada para visualizar as células e seus componentes, pois muitas células são incolores e transparentes. Alguns componentes da célula amam o ácido, enquanto algumas partes amam a base. Os corantes ácidos e os corantes básicos são dois tipos de corantes usados com freqüência em procedimentos específicos. A coloração basofílica usa corantes básicos, enquanto a coloração acidofílica usa corantes ácidos. Portanto, os componentes acidofílicos ou que amam o ácido se ligam aos corantes ácidos, enquanto os componentes basofílicos ou que amam a base se ligam aos corantes básicos.