A principal diferença entre a cromatofocagem e a focagem isoelétrica é que a cromatofocagem é um tipo de método de cromatografia em coluna que utiliza resinas de troca iônica, enquanto a focalização isoelétrica é um tipo de técnica de eletroforese que utiliza géis de gradiente de pH imobilizados.
Cromatofocalização e focalização isoelétrica são duas técnicas que separam proteínas de acordo com seus pontos isoelétricos. Tanto a cromatografia quanto a focagem isoelétrica têm grande poder de resolução. A cromatofocalização é um método de cromatografia em coluna de alta resolução, enquanto a focagem isoelétrica é um método de separação eletroforética. Além disso, a cromatofocalização não usa um campo elétrico, enquanto a focagem isoelétrica precisa de um campo elétrico.
