Diferença chave - genotipagem vs sequenciamento
Genotipagem e sequenciamento são duas técnicas realizadas para obter informações sobre os ácidos nucléicos, principalmente o DNA de um organismo. A principal diferença entre genotipagem e sequenciamento é que a genotipagem é o processo de determinar qual variante genética o indivíduo possui usando marcadores, enquanto o sequenciamento é a determinação da ordem correta da sequência de nucleotídeos dentro de um determinado fragmento de DNA.
CONTEÚDO
1. Visão geral e diferença fundamental
2. O que é genotipagem
3. O que é sequenciamento
4. Comparação lado a lado - Genotipagem versus sequenciamento
5. Resumo
O que é genotipagem?
Genotipagem é a determinação da composição genética de um indivíduo usando uma sequência de DNA e marcadores e comparação e identificação de sua herança. A genotipagem é importante na biologia evolutiva, biologia populacional, taxonomia, ecologia e genética dos organismos. Pode ser realizado por diferentes técnicas, incluindo sequenciamento de DNA, reação em cadeia da polimerase, polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP), detecção polimórfica amplificada aleatoriamente, polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado (AFLP), microarranjos de DNA, etc.
A genotipagem envolve o sequenciamento de pequenos fragmentos específicos de sequências de DNA e a descoberta da relação da composição genética com outros indivíduos usando marcadores genéticos. Ele determina os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) entre os indivíduos ou os alelos específicos. A genotipagem é aplicável a uma ampla gama de organismos, incluindo humanos. Também é aplicável a microrganismos como vírus, fungos etc. e pode ser usado para determinar suas variantes genéticas com os perfis de referência. Na epidemiologia molecular e na microbiologia forense, o controle dos patógenos, principalmente dos microrganismos, é feito a partir das informações obtidas na genotipagem. A genotipagem é muito importante na análise de pedigree. Os humanos são genotipados para confirmar a maternidade e a paternidade. O genótipo revelará os alelos dominantes e recessivos dos genes que decidem características específicas.
Figura_1: Genotipagem RFLP
O que é sequenciamento?
O sequenciamento é o processo de determinar a ordem correta do nucleotídeo em um determinado fragmento de DNA ou RNA. Praticamente todas as informações necessárias para o crescimento e desenvolvimento de um organismo estão codificadas em seu genoma. A disponibilidade de técnicas para produzir e separar fragmentos de ácidos nucléicos de algumas centenas de nucleotídeos levou ao desenvolvimento de procedimentos para determinar a seqüência exata de nucleotídeos de um dado fragmento de DNA ou RNA. Diferentes tipos de métodos de sequenciamento estão disponíveis hoje. Esses métodos de sequenciamento, juntamente com as tecnologias para construção de bibliotecas de genomas que representam todo o genoma de um organismo, facilitam o sequenciamento de todo o genoma desse organismo, fazendo análises aprofundadas de estruturas gênicas, funções gênicas, localizações gênicas, expressões gênicas mapeamento de genes, regiões regulatórias de genes etc.
Os genomas totais de muitos vírus, várias bactérias, arqueobactérias, leveduras e vários outros organismos foram sequenciados e mapeados. O projeto do genoma humano tornou possível sequenciar e mapear todo o genoma humano e publicar seu primeiro esboço em 2003. É um marco importante no avanço da biologia. As sequências do genoma humano são agora usadas no setor médico para identificar causas genéticas para doenças raras, rastrear o risco de doenças em recém-nascidos, identificar detalhes genéticos de diferentes cânceres, desenvolver novas terapêuticas e desenvolver novas ferramentas de diagnóstico, etc.
No mundo das plantas, o genoma do arroz e os genomas da Arabidopsis foram sequenciados. O conhecimento dessas sequências, sem dúvida, revolucionará nossa compreensão de como as células e os organismos funcionam.
Figura_2: Uma autorradiografia de sequenciamento de sanger
Qual é a diferença entre Genotipagem e Sequenciamento?
Artigo Diff meio antes da tabela
Genotipagem vs Sequenciamento |
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| Genotipagem é o processo de determinar a composição genética de um indivíduo e verificar o grupo ou a taxonomia desse organismo. | Sequenciamento é o processo de determinar a ordem precisa dos nucleotídeos de um determinado DNA ou fragmento de RNA. |
| Técnicas | |
| RFLP, sequenciamento de genes, PCR, microarrays de DNA, AFLP etc. | Sequenciamento de Sanger, sequenciamento de Gilbert, pirosequenciamento, sequenciamento de próxima geração, sequenciamento de espingarda etc. |
| Principais preocupações | |
| Ele está mais preocupado em saber se as diferenças de genótipo estão dando as diferenças reais de fenótipo. | Este está mais preocupado com a ordem dos nucleotídeos e suas diferenças e mudanças com outros organismos. |
Resumo - Genotipagem vs Sequenciamento
A genotipagem e o sequenciamento são úteis para estudar a informação genética dos organismos. Genotipagem é o processo de determinar as variações do genótipo entre os indivíduos e encontrar suas categorias. Sequenciamento é o processo de determinar a ordem correta dos nucleotídeos no fragmento interessado ou na região do DNA. Ambas as técnicas fornecem informações importantes sobre os genes e genomas.
