A principal diferença entre íons poliatômicos e compostos é que os íons poliatômicos têm carga elétrica positiva ou negativa, enquanto os compostos não têm carga elétrica líquida.
Um íon poliatômico é um termo que usamos para nomear espécies químicas que contêm dois ou mais átomos com carga elétrica negativa ou positiva. A carga elétrica desse íon é resultado do número de elétrons presentes em cada átomo; se houver mais elétrons do que o número total de prótons nos átomos, ele recebe uma carga líquida negativa e vice-versa. Os compostos, por outro lado, são espécies químicas sem carga elétrica. Eles têm o mesmo número de elétrons e prótons.