A principal diferença entre a cromatografia de par iônico e a cromatografia de troca iônica é que, na cromatografia de par iônico, os íons na amostra podem ser "emparelhados" e separados como o par iônico, ao passo que, na cromatografia de troca iônica, os íons na amostra podem ser separados como cátions e ânions separadamente.
A cromatografia é uma técnica importante que leva à separação de diferentes componentes em uma mistura. A cromatografia de par iônico e de troca iônica são técnicas analíticas que podemos usar para separar íons e moléculas polares em uma mistura, com base na carga elétrica que carregam com eles.