A principal diferença entre estrume e matéria orgânica é que o estrume é uma forma de matéria orgânica feita pelo homem, enquanto a matéria orgânica são compostos ricos em carbono formados naturalmente no solo.
As plantas são os principais produtores em nossos ecossistemas. Por isso, são importantes no fornecimento de alimento para outros animais e também participam da manutenção do equilíbrio natural. As plantas também precisam de comida e água para crescer. Eles dependem do solo para alimentação, água e habitat. Portanto, o solo precisa estar em condições saudáveis e a matéria orgânica é necessária para manter a qualidade do solo. A matéria orgânica são os compostos que contêm carbono. No solo, existem muitas formas de matéria orgânica. Em contraste, o estrume é feito pelo homem e contém todos os nutrientes essenciais necessários para o aumento da saúde do solo. Conseqüentemente, matéria orgânica e esterco são duas terminologias muito importantes na biologia do solo e na agricultura.