A principal diferença entre assim e, portanto, é que significa "por esse meio" ou "como resultado disso", enquanto que, portanto, significa "por esse motivo" ou conseqüentemente.
Ambos, portanto, são advérbios que usamos como palavras de transição. Embora pareçam e soem um tanto semelhantes, há uma diferença distinta entre eles e, portanto, em termos de significado e uso. Assim, geralmente indica o resultado subsequente da cláusula que o precede, enquanto, portanto, indica a razão pela qual algo aconteceu ou foi feito como resultado da cláusula que o precede. Além disso, quando comparado com portanto, é mais formal e menos comum, especialmente em conversas.