A principal diferença entre a eletroforese em gel 1D e 2D são as propriedades usadas para a separação de proteínas na eletroforese em gel. A eletroforese em gel 1D separa apenas as proteínas com base no peso molecular, enquanto a eletroforese em gel 2D separa as proteínas com base em seu ponto isoelétrico e peso molecular.
A separação de proteínas por eletroforese em gel é uma técnica importante para caracterizar proteínas. As proteínas têm propriedades variáveis; portanto, a separação é mais complexa em comparação com a separação do DNA por eletroforese em gel de agarose.
