A principal diferença entre orbitais híbridos e degenerados é que orbitais híbridos são novos orbitais que se formam a partir da mistura de dois ou mais orbitais, enquanto orbitais degenerados existem originalmente em um átomo.
Como o próprio nome indica, um orbital híbrido é um híbrido de dois ou mais orbitais. Embora o nome orbital degenerado pareça o mesmo, eles não são orbitais recém-formados - eles já existem em um átomo. Além disso, todos os orbitais híbridos em uma molécula têm a mesma energia, enquanto os orbitais degenerados em um átomo têm a mesma energia.