A principal diferença entre homozigoto e heterozigoto é que homozigoto significa que ambos os alelos são semelhantes para uma característica, enquanto heterozigoto significa que os dois alelos são diferentes para uma característica.
Os genes herdados dos cromossomos dos pais controlam todos os caracteres ou traços de animais, plantas e todos os outros seres vivos. É a razão central para mostrar características parentais na progênie. A maioria dos organismos eucarióticos tem dois conjuntos de genes conhecidos como genes maternos e genes paternos. Portanto, a situação genética é conhecida como diplóide (dois conjuntos de cromossomos). Que significa; todas as características têm componentes genéticos da mãe e do pai. No entanto, esses genes podem ser dominantes ou recessivos entre si e é aí que as características homozigotas e heterozigotas se tornam importantes. Homozigoto é um estado de ter dois alelos dominantes (AA) ou dois alelos recessivos (aa), enquanto heterozigoto é um estado de ter um alelo dominante e um alelo recessivo (Aa).